民國八十七年七月，一群熱愛生命、關心流浪動物的愛心媽媽，前往當時縣議員胡俊傑服務處，表達澎湖縣流浪動物的悲慘實況，與迫切需求，經由縣議員的協助、縣長的支持，結合縣內獸醫師，關心生命廣大的善心志工，開始定期集會，研議建立澎湖縣內，合理的運作機制、關懷系統、與經費爭取等工作，歷經多次研討，參考國內已具操作實務的團體經驗，於民國八十七年十月二十六日正式成立本會，開始為本縣流浪動物，投注關懷的暖流。

二、經營澎湖縣保護動物之管理構想：

　澎湖縣流浪犬收容所是本協會於八十七年底積極向賴縣長爭取建置的地點，本會陸續投入許多經費及志工協助處理流浪動物，付出無限愛心與關懷，經營一年多，直到八十九年澎湖縣家畜疾病防治所接管。

　迫於缺少經費，硬體簡陋，動物醫療不足與缺乏制度管理，近年來本會與眾多會員、社會愛心人士、及志工團體們，皆懇切渴望，能將現有流浪犬收容所，做更充份的運用，落實動保護法之執行與宣導，加強國民尊重動物生命及保護、管理動物觀念、改善環保、交通、安全等問題。讓澎湖縣的流浪動物，能在理想的動收容所作業公式中，依照政府動物保護法的立法精神，早日獲得人類的關懷、享有應得的生命尊重。

三、重要工作及實施方式：

1. 為有效控制本縣狗口數量，從學校（有學生義工）、軍中（時常將幼犬送到收容所、協會也幫過數隻母犬結紮），透過村里幹事了解各村公母狗數量，以及捕犬汽車廣告、廣播宣導。宣導正確養狗關念、常識及責任，避免民眾棄養造成流浪犬問題，並鼓勵認養流浪犬代替買賣，同時宣導結紮之重要，共同改善我們的流浪犬問題。

2. 本協會在會址提供近二十隻中小型健康寵物狗（已結紮並植入晶片），提供外借小朋友達成養狗夢，了解養狗所遇一些甘苦、困難處，以減低養狗慾望，即減少買賣，就沒有繁殖。